MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 30317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	532530468
2	NC_022130	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530468
3	NC_022130	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	532530468
4	NC_022130	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532530468
5	NC_022130	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530468
6	NC_022130	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	532530468
7	NC_022130	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	532530468
8	NC_022130	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530468
9	NC_022130	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530468
10	NC_022130	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	532530468
11	NC_022130	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530469
12	NC_022130	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530469
13	NC_022130	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	532530469
14	NC_022130	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	532530469
15	NC_022130	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530469
16	NC_022130	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	532530469
17	NC_022130	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530469
18	NC_022130	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530470
19	NC_022130	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530470
20	NC_022130	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530470
21	NC_022130	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530470
22	NC_022130	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530470
23	NC_022130	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	532530470
24	NC_022130	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530470
25	NC_022130	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	532530470
26	NC_022130	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530470
27	NC_022130	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	532530470
28	NC_022130	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	532530470
29	NC_022130	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	532530470
30	NC_022130	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530470
31	NC_022130	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530470
32	NC_022130	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530471
33	NC_022130	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	532530471
34	NC_022130	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	532530471
35	NC_022130	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	532530471
36	NC_022130	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	532530471
37	NC_022130	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	532530471
38	NC_022130	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530471
39	NC_022130	T	7	7	1976	1982	0 %	100 %	0 %	0 %	532530472
40	NC_022130	TTC	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530472
41	NC_022130	TCA	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530472
42	NC_022130	AAT	2	6	2105	2110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530472
43	NC_022130	G	6	6	2190	2195	0 %	0 %	100 %	0 %	532530472
44	NC_022130	ATTC	2	8	2350	2357	25 %	50 %	0 %	25 %	532530472
45	NC_022130	TG	3	6	2522	2527	0 %	50 %	50 %	0 %	532530473
46	NC_022130	A	8	8	2543	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	532530473
47	NC_022130	CTTT	2	8	2560	2567	0 %	75 %	0 %	25 %	532530473
48	NC_022130	T	6	6	2639	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	532530473
49	NC_022130	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530474
50	NC_022130	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	532530474
51	NC_022130	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	532530474
52	NC_022130	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530474
53	NC_022130	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530474
54	NC_022130	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530474
55	NC_022130	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530474
56	NC_022130	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530474
57	NC_022130	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
58	NC_022130	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
59	NC_022130	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	532530475
60	NC_022130	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530475
61	NC_022130	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	532530475
62	NC_022130	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	532530475
63	NC_022130	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	532530475
64	NC_022130	A	6	6	3890	3895	100 %	0 %	0 %	0 %	532530475
65	NC_022130	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530475
66	NC_022130	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530475
67	NC_022130	A	6	6	4702	4707	100 %	0 %	0 %	0 %	532530476
68	NC_022130	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530476
69	NC_022130	T	7	7	4771	4777	0 %	100 %	0 %	0 %	532530476
70	NC_022130	A	6	6	4786	4791	100 %	0 %	0 %	0 %	532530476
71	NC_022130	GCTT	2	8	5192	5199	0 %	50 %	25 %	25 %	532530477
72	NC_022130	ATTC	2	8	5219	5226	25 %	50 %	0 %	25 %	532530477
73	NC_022130	CATT	2	8	5263	5270	25 %	50 %	0 %	25 %	532530477
74	NC_022130	ATT	2	6	5285	5290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530477
75	NC_022130	C	6	6	5348	5353	0 %	0 %	0 %	100 %	532530477
76	NC_022130	TGG	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530477
77	NC_022130	A	6	6	5495	5500	100 %	0 %	0 %	0 %	532530477
78	NC_022130	TCT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530477
79	NC_022130	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	532530477
80	NC_022130	GTT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
81	NC_022130	TAA	2	6	5654	5659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530477
82	NC_022130	GTG	2	6	5781	5786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530477
83	NC_022130	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
84	NC_022130	GC	3	6	5843	5848	0 %	0 %	50 %	50 %	532530477
85	NC_022130	CAA	2	6	5849	5854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530477
86	NC_022130	GCTCG	2	10	5872	5881	0 %	20 %	40 %	40 %	532530477
87	NC_022130	TGT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
88	NC_022130	C	6	6	5947	5952	0 %	0 %	0 %	100 %	532530477
89	NC_022130	GTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
90	NC_022130	GCT	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
91	NC_022130	TTTGA	2	10	6056	6065	20 %	60 %	20 %	0 %	532530477
92	NC_022130	GCTTGC	2	12	6087	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
93	NC_022130	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530477
94	NC_022130	GCG	2	6	6160	6165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530477
95	NC_022130	CGA	2	6	6211	6216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530477
96	NC_022130	GCAT	2	8	6275	6282	25 %	25 %	25 %	25 %	532530477
97	NC_022130	TGC	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
98	NC_022130	TGT	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
99	NC_022130	TTG	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
100	NC_022130	TTGC	2	8	6533	6540	0 %	50 %	25 %	25 %	532530477
101	NC_022130	T	6	6	6606	6611	0 %	100 %	0 %	0 %	532530477
102	NC_022130	TGGT	2	8	6731	6738	0 %	50 %	50 %	0 %	532530477
103	NC_022130	AAC	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530477
104	NC_022130	CCG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530477
105	NC_022130	ATCG	2	8	6914	6921	25 %	25 %	25 %	25 %	532530477
106	NC_022130	GCT	2	6	6941	6946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530477
107	NC_022130	CG	3	6	6959	6964	0 %	0 %	50 %	50 %	532530477
108	NC_022130	GTT	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530477
109	NC_022130	TTTTA	2	10	7329	7338	20 %	80 %	0 %	0 %	532530478
110	NC_022130	TTTG	2	8	7379	7386	0 %	75 %	25 %	0 %	532530478
111	NC_022130	T	6	6	7391	7396	0 %	100 %	0 %	0 %	532530478
112	NC_022130	C	6	6	7426	7431	0 %	0 %	0 %	100 %	532530478
113	NC_022130	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530478
114	NC_022130	AAGC	2	8	7465	7472	50 %	0 %	25 %	25 %	532530478
115	NC_022130	CAT	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
116	NC_022130	GCC	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530479
117	NC_022130	TCT	2	6	7547	7552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
118	NC_022130	GAAACC	2	12	7595	7606	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532530479
119	NC_022130	AAT	2	6	7645	7650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530479
120	NC_022130	TTCA	2	8	7723	7730	25 %	50 %	0 %	25 %	532530479
121	NC_022130	CAT	2	6	7743	7748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
122	NC_022130	GC	3	6	7790	7795	0 %	0 %	50 %	50 %	532530479
123	NC_022130	ATG	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530479
124	NC_022130	TCA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
125	NC_022130	CG	3	6	7855	7860	0 %	0 %	50 %	50 %	532530479
126	NC_022130	GCCGC	2	10	7868	7877	0 %	0 %	40 %	60 %	532530479
127	NC_022130	CTT	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
128	NC_022130	CAT	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530479
129	NC_022130	T	6	6	7942	7947	0 %	100 %	0 %	0 %	532530479
130	NC_022130	AG	3	6	8002	8007	50 %	0 %	50 %	0 %	532530479
131	NC_022130	TCTT	2	8	8017	8024	0 %	75 %	0 %	25 %	532530479
132	NC_022130	GTG	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530479
133	NC_022130	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530479
134	NC_022130	CCG	2	6	8228	8233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530479
135	NC_022130	TTTCT	2	10	8259	8268	0 %	80 %	0 %	20 %	532530479
136	NC_022130	CAC	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530479
137	NC_022130	GAT	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530479
138	NC_022130	T	6	6	8403	8408	0 %	100 %	0 %	0 %	532530479
139	NC_022130	T	7	7	8442	8448	0 %	100 %	0 %	0 %	532530479
140	NC_022130	CGTT	2	8	8499	8506	0 %	50 %	25 %	25 %	532530479
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146	NC_022130	T	6	6	8994	8999	0 %	100 %	0 %	0 %	532530479
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181	NC_022130	A	6	6	11396	11401	100 %	0 %	0 %	0 %	532530482
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272	NC_022130	T	6	6	15568	15573	0 %	100 %	0 %	0 %	532530487
273	NC_022130	CTT	2	6	15660	15665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530487
274	NC_022130	AAG	2	6	15701	15706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
275	NC_022130	AGA	2	6	15711	15716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530487
276	NC_022130	ATG	2	6	15878	15883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530487
277	NC_022130	T	6	6	15900	15905	0 %	100 %	0 %	0 %	532530487
278	NC_022130	TAT	2	6	15964	15969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530487
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280	NC_022130	A	6	6	15999	16004	100 %	0 %	0 %	0 %	532530487
281	NC_022130	T	7	7	16022	16028	0 %	100 %	0 %	0 %	532530487
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284	NC_022130	A	7	7	16211	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	532530487
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399	NC_022130	TGA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530494
400	NC_022130	AGA	2	6	23818	23823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530494
401	NC_022130	TAT	2	6	23844	23849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530494
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403	NC_022130	A	6	6	23908	23913	100 %	0 %	0 %	0 %	532530494
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